Подумай сам, если он в Z переместился, значит его либо выполнили уже с указанной такой координатой, либо глю при переносе или недоглядели когда копировали. Смасштабировать тоже могли не по всем осям.
Короче, какая тебе разница, если нужно чтобы было Z=0, то выбираешь все обьекты по типам и присваиваешь им через свойства 0 в координате, а в следующий раз копируя просто будешь обращать внимание, на то как выполнен чертеж, и как копируешь.
Еще изучи команду "OSNAPZ"